COPASI

COPASI提供全面的生化网络模拟套件。用户可选择最合适的数学框架：使用常微分方程进行确定性建模以处理大种群平均值，或采用Gillespie算法进行随机建模以捕捉小系统中的固有噪声。支持SBML文件确保其他工具构建的模型可轻松导入和模拟。参数拟合、分岔分析和生成可发表质量图表等附加功能，简化了从模型创建到结果解释的整个工作流程。